Το τμήμα μπάσκετ γυναικών του Παναθηναϊκού είναι το πρώτο που ιδρύθηκε στην Ελλάδα το 1937 και αναμφίβολα αποτελεί μία ακόμα πρωτοπορία του «τριφυλλιού».
Οι «πράσινες» άρχισαν να κάνουν αισθητή την παρουσία τους στις αρχές της δεκαετίας του ΄50 και είναι χαρακτηριστικό ότι κατέκτησαν το πρωτάθλημα Αθήνας το 1950 ενώ λίγα χρόνια αργότερα το 1954 κατέκτησαν το κύπελλο Πάσχα. Λίγο νωρίτερα, το 1948 η δεύτερη ομάδα του ΠΑΟ είχε κατακτήσει το κύπελλο Μαντέλλου.
Μέχρι και το 1967 περίπου ο κορμός της ομάδας αποτελούταν συχνά από αθλήτριες που ανήκαν στις οικογένειες αθλητών η παραγόντων του Συλλόγου και προπονούνταν στο κλειστό της Λεωφόρου από το 1960 περίπου.
Από το 1983 η ομάδα συμμετέχει στα πρωταθλήματα της μεγάλης κατηγορίας και έπεσε την σεζόν 2017-18 όταν αναγκάστηκε να αγωνιστεί με νεάνιδες.
Στο ενδιάμεσο οι «μαχητικές ψυχές» είχαν πανηγυρίσει τέσσερα πρωταθλήματα και ένα κύπελλο Ελλάδας.
Κορυφαία σεζόν του τμήματος θεωρείται η χρονιά 1999-2000 που κατέκτησε πρωτάθλημα και κύπελλο επί διοίκησης Θοδωρή Αλούπη.
Προπονήτρια της ομάδας ήταν η Γιασεμή Σαμαντούρα ενώ αγωνίστηκαν οι Ρόμπινσον, Βαν Γκορπ, Καλεντζου, Νικολαϊδου, Παπαδήμου, Παπαμιχαήλ, Τριαλώνη, Λιάκου, Κουμιώτη και Ρογκίτη.
Το 13άρι του Μπάσκετ γυναικών του ΠΑΝΑΘΗΝΑΪΚΟΥ
1)Τσομπανάκη
Χάλκινο μεσογειακους 1991
2)Λίλα Χατζηορίδου
3η βαλκανικους νεανιδων
3)Τούλα Καλέντζου
Προημιτελικά Λιλιάνα Ρονκέτι, 3 πρωταθλήματα, 1 κύπελλο
4)Νένα Νικολαϊδου
Προημιτελικά Λιλιάνα Ρονκέτι, 3 πρωταθλήματα, 1 κύπελλο
5) Αφέντρα Παπαδήμου
Προημιτελικά Λιλιάνα Ρονκέτι, 3 πρωταθλήματα, 1 κύπελλο
6) Αλεξία Τριαλώνη
Προημιτελικά Λιλιάνα Ρονκέτι, 2 πρωταθλήματα, 1 κύπελλο
7) Παπαμιχαήλ
Προημιτελικά Λιλιάνα Ρονκέτι, 2 πρωταθλήματα, 1 κύπελλο
8)Τσέρου
Προημιτελικά Λιλιάνα Ρονκέτι, 2 πρωταθλήματα, 1 κύπελλο
9)Τσένκινς
Προημιτελικά Λιλιάνα Ρονκέτι και πρωτάθλημα
10) Κάπουλα,
Προημιτελικά Λιλιάνα Ρονκέτι και πρωτάθλημα
11) Πομόνη
Προημιτελικά Λιλιάνα Ρονκέτι και πρωτάθλημα
12) Γεωργιάδη
Προημιτελικά Λιλιάνα Ρονκέτι και πρωτάθλημα
13) Τάνση
Προημιτελικά Λιλιάνα Ρονκέτι και πρωτάθλημα