Σημαδιακή ήταν η 26η Οκτωβρίου 1912 καθώς έγινε η απελευθέρωση της Θεσσαλονίκης και όμως καθοριστικό ρόλο σε αυτό έπαιξε και ο …Παναθηναϊκός.
Ο Σύλλογος μετρούσε τότε τέσσερα χρόνια ζωής τότε και δύο στελέχη του «τριφυλλιού» αποδείχτηκαν καθοριστικά στην απελευθέρωση της Θεσσαλονίκης.
Πιο συγκεκριμένα ο Νικόλαος Βότσης ήταν μέλος του Διοικητικού Συμβουλίου του Παναθηναϊκού εκείνα τα χρόνια.Κατά τη διάρκεια του Α΄ Βαλκανικού πολέμου (1912)κυβερνώντας το Τορπιλοβόλο 11 εισήλθε στο οχυρωμένο λιμάνι της Θεσσαλονίκης χωρίς να γίνει αντιληπτός, όπου και εκτόξευσε τρεις τορπίλες κατά της τουρκικoύ θωρηκτού “Φετχί Μπουλέντ” 3.000 τόνων, με αποτέλεσμα οι δύο τορπίλες να ευστοχήσουν το τουρκικό πολεμικό πλοίο, να βυθιστεί και ο Ν. Βότσης να αποχωρήσει χωρίς καμία απώλεια.
Η συγκεκριμένη παράτολμη ενέργεια που ήταν δική του πρωτοβουλία θεωρείται ένα από τα σημαντικότερα γεγονότα για την απελευθέρωση της Θεσσαλονίκης.
Παράλληλα ένα ακόμα σημαντικό πρόσωπο της απελευθέρωσης το 1912 ήταν το μέλος του Παναθηναϊκού Φίλιππος Νίκογλου.
Επρόκειτο για έναν γιατρό που ήταν στη Σόφια εκείνη την περίοδο και παράλληλα ήταν υπίατρος στο Βουλγαρικό στρατό. Ήταν εκείνος που μετέδωσε καθοριστικές πληροφορίες στην Ελλάδα και βοήθησε σημαντικά με τον τρόπο του.