Ο Σύλλογος Μεγάλος συνδέεται με τον Πανθρακικό λόγω των χρωμάτων, καθώς αμφότεροι τιμούν τον συνδυασμό πράσινο-λευκό.
Ο Πανθρακικός ιδρύθηκε το 1963, έπειτα από τη συνένωση του Ορφέα με την ΑΕ Κομοτηνής. Ωστόσο, αυτό που δεν είναι ιδιαιτέρως γνωστό είναι ότι υπήρχε και τρίτος σύλλογος στη συγχώνευση, ο Θρακικός (φορούσε και αυτός πράσινα), στον οποίο φαίνεται ότι έμοιασε περισσότερο το νέο σωματείο (σε χρώματα και όνομα).
Ίσως να μην είναι τυχαίο το γεγονός ότι το ρεκόρ εισιτηρίων του γηπέδου είναι «καταπράσινο» και έχει σημειωθεί στην αναμέτρηση Πανθρακικού-Παναθηναϊκού στις 13 Σεπτεμβρίου 2009, όταν κόπηκαν συνολικά 5.355 εισιτήρια.
Τέλος, υπάρχουν ποδοσφαιριστές που αγωνίστηκαν αρχικά στον Παναθηναϊκό για να καταλήξουν αργότερα στην ομάδα του νομού Ροδόπης, όπως οι Δημήτρης Παπαδόπουλος, Ξενοφών Γήττας, Χρήστος Μελίσσης και Βλάσης Καζάκης.
