Ο Παναθηναϊκός είναι η ομάδα της Αθήνας και της Ελλάδας ολόκληρης και η Μικτή Αθηνών διαχρονικά βασιζόταν στο «τριφύλλι». Οι «πράσινοι» έδιναν και δίνουν συνεχώς αθλητές στα μικτά κλιμάκια της πρωτεύουσας και η συγκεκριμένη ομάδα είναι άρρηκτα δεμένη με τους «πράσινους».
Από το μακρινό 1925 η βάση της Μικτής Αθηνών ήταν ο Παναθηναϊκός και αυτό φάνηκε την άνοιξη εκείνου του έτους,.
Μετά τη λήξη του πρωταθλήματος συγκροτήθηκε η Μικτή Αθηνών ενόψει των αγώνων της με την Μικτή Πειραιά για το Κύπελλο Πόλεων Αθηνών-Πειραιώς. Για την επιλογή των καλύτερων παικτών η ΕΠΣΑ διοργάνωσε την Κυριακή 3 Μαΐου 1925 ποδοσφαιρικό αγώνα στο γήπεδο Λεωφόρου μεταξύ της “Μικτής Παναθηναϊκού-Ενώσεως Κωνσταντινουπόλεως” και της “Μικτής όλων των άλλων σωματείων ηνωμένων”.
“Ο αγών προβλέπεται μεγάλου ενδιαφέροντος καθόσον εκ των 22 παικτών των δύο τούτων μικτών ομάδων θα σχηματισθή η τελική μικτή ομάς Αθηνών ήτις θα συναντηθή προσεχώς με την μικτήν Πειραιώς δια το πρωτάθλημα πόλεων Αθηνών-Πειραιώς
Η Μικτή Αθηνών συγκροτήθηκε από πέντε παίκτες του Παναθηναϊκού (Καλογερόπουλος, Νικολαΐδης, Σ. και Θ. Ασπρογέρακας, Πανουργιάς), πέντε της ΑΕΚ (Ιερεμιάδης, Δημόπουλος, Κεχαγιόγλου, Μιχαηλίδης, Μπαλτάς) και έναν του Ατρομήτου (Σταθόπουλος). Ο αγώνας για το Κύπελλο των δύο πόλεων διεξήχθη στις 24 Μαΐου 1925 στο γήπεδο της Λεωφόρου, παρουσία των δύο δημάρχων, οι οποίοι είχαν αθλοθετήσει και το κύπελλο του νικητή:
“Την προσεχή Κυριακήν 24 τρέχ. εις το γήπεδον του Παναθηναϊκού θα λάβη χώραν ο ετήσιος αγών πόλεων Αθηνών-Πειραιώς επί παρουσία των Δημάρχων κ.κ. Πάτση και Παναγιωτοπούλου. Αμφότεραι αι ομάδες καταρτισθείσαι εκ των καλλιτέρων ποδοσφαιριστών Αθηνών-Πειραιώς θα διεκδικήσουν μετά πείσματος την νίκην και το κύπελλον όπερ αθλοθέτησαν οι δύο Δήμαρχοι.
Ο Παναθηναϊκός παρέμεινε ο κεντρικός αιμοδότης της Μικτής Αθηνών και τα επόμενα χρόνια ενώ αξιοσημείωτο ήταν το φιλικό του 1932 μεταξύ ΠΑΟ και Μικτής Αθηνών που έληξε 5-5! Και αυτή είναι η μεγαλύτερη ισοπαλία στην ιστορία του Συλλόγου.
Σε τέτοιο βαθμό μάλιστα όπου στα τέλη του Αυγούστου του 1962 ο Παναθηναϊκός αγωνίστηκε ως Μικτή Αθηνών στη Θεσσαλονίκη καθώς αποτελούσε την αφρόκρεμα του ποδοσφαίρου της πόλης.
Αξίζει να σημειωθεί ότι διαχρονικά η βάση της Μικτής Αθηνών ήταν Ο ΠΑΟ ενώ επί προεδρίας «παππού» Ανδρέα Βγενόπουλου στην ΕΠΣΑ η Μικτή Αθηνών γνώρισε τις σημαντικότερες επιτυχίες της με σπουδαία φιλικά σε όλη την Ελλάδα και πολύ συχνά στο εξωτερικό.
